Miguel Guzmán en Historia de los Deportes Olímpicos explica que el pentatlón es la primera prueba física combinada que se conoce. Su génesis se remonta a la Antigüedad, exactamente a la 18ª Olimpiada Antigua, alrededor del 708 aC y consideraba: carrera, salto, lanzamiento de disco, lanzamiento de jabalina y lucha.  Actualmente, presenta dos modalidades: moderno y militar. 

El pentatlón moderno es un deporte olímpico, propuesto por el fundador de los Juegos Olímpicos modernos, el barón Pierre de Coubertin y debutó en certamen de Estocolmo  1912. Esta disciplina estuvo dominado por los atletas suecos hasta después de la Segunda Guerra Mundial, luego Hungría y la Unión Soviética se convirtieron en los países más poderosos. Consta de cinco pruebas: salto ecuestre con obstáculos, esgrima, tiro, natación en 200 metros libres y carrera.  

A fines de la década de 1960, bajo la dirección del profesor Aldo del Río, la Institución comenzó a tener protagonismo en esta disciplina. Sobresale el más tarde Coronel, Aquiles Gloffka Ovalle, Campeón Nacional individual (1961 y desde 1963 a 1970) y siete veces por equipo y figura en campeonatos sudamericanos. También, fue elegido como el mejor pentatleta de Chile durante los años 1961, 1966, 1968 y 1969. Otros representantes distinguidos fueron los Tenientes Eliecer Mendoza López (1960) y José Jordán Soto (1972).

El pentatlón militar tomó protagonismo con posterioridad a la Segunda Guerra Mundial, cuando el capitán francés Henri Debrus, propuso a los altos mandos militares la idea de organizar un torneo deportivo exclusivo para el ejército. La primera competencia fue en 1947, en el Centro de Entrenamiento Físico Militar en Friburgo,  Alemania, explica Doctor en Actividad y Salud de la Universidad de Granada, España, Álvaro Huerta Ojeda en Evolución del pentlatón militar como disciplina de alto rendimiento. Consiste en cinco pruebas: Cross-country, tiro, carrera de obstáculos, lanzamiento de granada y natación.

En 1976, el Aspirante a Oficial y más tarde Teniente Coronel (I) Juan Moraga Gallegos, batió el récord chileno en lanzamiento de granadas con una distancia de 59 metros y 33 centímetros. Otros destacados deportistas de la época fueron el Teniente Coronel Juan Abarca Rubio, el Mayor (I) Juan Moraga Gallegos, el Mayor Julio Benimeli Ruiz y los capitanes Fermín Guíñez Naudón, Néstor Lavín Soto y Julio Sagredo. 

En octubre de 1989, el cuadro institucional se coronó campeón por equipos e individual en el campeonato InterEscuelas Matrices del Cuadro Permanente, gracias a los carabineros Freddy Romero Valenzuela y Guillermo Retamal Flores y en diciembre de ese año la Institución participó en el torneo de la especialidad que programó la Confederación Deportiva de la Defensa Nacional (CODEFEN). En la oportunidad, el equipo nacional obtuvo el 2° lugar por equipos, ante representes del Ejército, Armada, Fuerza Aérea y Policía de Investigaciones. De manera individual destacaron los Carabineros Guillermo Retamal Flores y Walter Durán Araneda. 

Más adelante sobresale el Sargento 2° Luis Díaz Plaza, quien obtuvo el Lautaro de Oro, distinción que desde 1977 se entrega al mejor deportista de cada institución. En 2014 clasificó al campeonato mundial desarrollado en Yeongcheon, Corea, repitiendo la hazaña un año más tarde. En 2016 alcanzó el 5° lugar individual en cross country en el Wiener Neustadt de Austria, a lo que se suma otra brillante participación en Ecuador 2017. Al año siguiente, retorna a Austria y en 2019 a Wuhan, China, siempre destacando sobre la media.  En damas sobresale la Cabo 1° Jovita Muñoz Fernández, cuya participación en los últimos campeonatos mundiales ha dejado en alto el nombre de la Institución.